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| 401 | DP-No.2株及びGG-No.1株を利用して生産されたグルタミルバリルグリシン | 2015年4月24日 | 2015年7月28日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 402 | DP-No.2株を利用して生産されたアスパルテーム | 2015年8月7日 | 2015年12月1日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 403 | DP-No.1株及びGG-No.1株を利用して生産されたグルタミルバリルグリシン | 2015年1月28日 | 2015年4月21日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 404 | DP-No.1株を利用して生産されたアスパルテーム | 2011年6月14日 | 2012年3月1日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 405 | DIDK-0176株を利用して生産されたホスホリパーゼ | 2021年11月8日 | 2023年4月12日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 406 | DHA産生及び除草剤グルホシネート耐性キャノーラ（NS-B50027-4）（飼料） | 2021年5月17日 | 2025年9月11日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 407 | DHA産生及び除草剤グルホシネート耐性キャノーラ（NS-B50027-4）（食品） | 2021年5月18日 | 2025年5月14日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 408 | CYS-No.1株を利用して生産されたL-システイン塩酸塩 | 2015年6月24日 | 2015年10月6日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 409 | CRC2836-13885 LVS_ETD MB#2株を利用して生産されたフィターゼ | 2024年11月5日 | 2025年2月5日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 410 | CPR株を利用して生産されたL-シトルリン（取り下げ） | 2014年6月19日 | - | 遺伝子組換え食品等 |
| 411 | CPR株を利用して生産されたL-シトルリン | 2017年7月7日 | 2017年10月31日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 412 | CN01-0118株を利用して生産された5’-イノシン酸二ナトリウム | 2011年12月5日 | 2012年3月1日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 413 | CIT-No.1株を利用して生産されたL-シトルリン | 2021年9月28日 | 2022年11月9日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 414 | CIN株を利用して生産されたキモシン | 2018年4月25日 | 2018年8月28日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 415 | CF307株を利用して生産されたキシラナーゼ | 2019年11月28日 | 2020年12月22日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 416 | CA02-1191株を利用して生産されたL-グルタミン酸ナトリウム（取下げ） | 2019年10月24日 | - | 遺伝子組換え食品等 |
| 417 | Bacillus subtilis NTI06 (pHYT2PsBG)株を利用して生産されたβ-グルコシダーゼ | 2024年8月13日 | - | 遺伝子組換え食品等 |
| 418 | Bacillus subtilis NTI06 (pHYT2MPM)株を利用して生産されたマルトースホスホリラーゼ | 2025年8月1日 | 2025年11月12日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 419 | Bacillus subtilis NTI05 (pHYT2Aopt) 株を利用して生産されたシクロデキストリングルカノトランスフェラーゼ | 2022年2月21日 | 2022年9月2日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 420 | Bacillus subtilis NTI04 (pHYT2TD) 株を利用して生産されたα-グルコシルトランスフェラーゼ | 2021年4月22日 | 2022年3月16日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 421 | Bacillus subtilis MDT121株を利用して生産されたα-アミラーゼ | 2013年4月10日 | 2014年11月11日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 422 | Bacillus subtilis BPN01株を利用して生産されたプロテアーゼ | 2014年2月5日 | 2014年5月13日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 423 | BRG-1(α-アミラーゼ)（取り下げ） | 2003年10月30日 | - | 遺伝子組換え食品等 |
| 424 | BR151（pUAQ2）株を利用して生産された6-α-グルカノトランスフェラーゼ | 2010年11月1日 | 2012年1月12日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 425 | BR151(pUMQ1)株を利用して生産された4-α-グルカノトランスフェラーゼ | 2011年11月8日 | 2012年2月16日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 426 | BML780PULm104株を利用して生産されたプルラナーゼ | 2019年2月14日 | 2019年7月2日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 427 | BML780 MDT06-221株を利用して生産されたα-アミラーゼ | 2020年11月2日 | 2021年6月1日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 428 | BDS株を利用して生産されたL-セリン | 2011年11月29日 | 2012年3月1日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 429 | Aspergillus oryzae NZYM-SP株を利用して生産されたアスパラギナーゼ | 2014年10月17日 | 2015年9月29日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 430 | Aspergillus oryzae MT2181株を利用して生産されたキシラナーゼ（取り下げ） | 2010年1月5日 | - | 遺伝子組換え食品等 |
| 431 | Aspergillus niger ASP-72 株を用いて生産されたアスパラギナーゼ | 2012年9月27日 | 2013年9月30日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 432 | ATC1562株を利用して生産された25-ヒドロキシコレカルシフェロール | 2012年12月20日 | 2015年1月7日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 433 | ASP595-1株を利用して生産されたフィターゼ | 2015年10月22日 | 2016年3月29日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 434 | ARG-No.4株を利用して生産されたL-アルギニン | 2017年4月20日 | 2017年8月8日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 435 | ARG-No.3株を利用して生産されたL-アルギニン | 2012年12月25日 | 2013年4月1日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 436 | ARG-No.2株を利用して生産されたL-アルギニン | 2009年8月31日 | 2009年12月3日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 437 | AHD株を利用して生産されたL-ヒドロキシプロリン | 2014年6月19日 | 2015年1月7日 | 遺伝子組換え食品等 |
| 438 | AH-No.1株を利用して生産されたL-カルノシン | 2025年3月4日 | 2025年6月26日 | 遺伝子組換え食品等 |